Đầu tiên, nước ngầm được bơm vào tháp oxy hóa. Tại đây thực hiện quá trình oxy hóa Fe2+ thành Fe3+ , Mn2+ thành Mn3+ để tạo thành hợp chất ít hòa tan Fe(OH)3, Mn(OH)3. Không khí được cấp vào bên trong tháp giúp tăng hiệu quả quá trình oxy hóa. Các chất kết tủa sinh ra từ quá trình oxy hóa sẽ được loại bỏ bởi các thiết bị lọc.